8 Aug 2026, 15:51 UTC40 views7 reactionsread 9 August 2026 Сделал игрушку для сравнения алгоритмов восстановления эволюционных параметров (Direct fitness inference и DiffEvol constraint из поста выше)
Можно менять мутации, силу отбора, размер выборки, параметры ландшафта, окна, моменты смены режима и даже специально ломать мутационную модель, чтобы посмотреть как расходятся частоты генотипов и эволюционные параметры. Я был удивлен тому, насколько хорошо (обычно) согласуются…
❤7
7 Aug 2026, 21:51 UTCviews —12 reactionsread 9 August 2026 Posted without readable text
😁12
7 Aug 2026, 15:00 UTC59 views7 reactionsread 9 August 2026 Video
Недавно вышли две замечательные работы по восстановлению эволюционных параметров из временных рядов частот генотипов
В одной выводят замкнутую формулу для восстановления относительного восстановления мальтузианской приспособленности генотипов с учетом мутационного потока. Метод усредняет динамику replicator-mutator по выбранному интервалу и решает полученную линейную систему через псевдообратную матрицу, получая оди…
❤4👍2🔥1
6 Aug 2026, 02:40 UTC59 views8 reactionsread 9 August 2026 You're Chilling In A Future City
❤6👍1🔥1
6 Aug 2026, 02:27 UTC61 views11 reactionsread 9 August 2026 Photo
Полноразмерные антитела слишком велики, чтобы проникать в мозг, и все более интересными выглядят нанотела - фрагменты антител верблюдовых (обычно лам). Рациональный дизайн в их отношении довольно прост, и в одной работе был создан DN13-DN1 - димер, часть которого связывается с глутаматным рецептором mGlu2, а другая усиливает его естественную активацию
Этот рецептор интересен в контексте гипофункции NMDA-рецепторов, …
❤6🔥2🤯2👍1
5 Aug 2026, 22:57 UTC56 views10 reactionsread 9 August 2026 Photo
Тут предложили элегантную платформу молекулярного распознавания на основе однослойной углеродной нанотрубки, покрытой "короной" из одноцепочечной ДНК. В зависимости от последовательности ДНК "корона" по-разному взаимодействует с ионами и малыми молекулами. Связывание аналита меняет фотолюминесценцию нанотрубки в ближнем ИК-диапазоне, а модель, обученная на откликах комплексов на ионы и антибиотики при разных значения…
❤6👍2🔥2
5 Aug 2026, 09:23 UTC61 views16 reactionsread 9 August 2026 Photo
Продолжая изучать необычные работы, я наткнулся на такую, в которой исследовали способы приготовить идеальный сырный соус cacio e pepe (просто иногда он распадается на крупные комки). Тут меняли температуру, количество крахмала и соотношение сыра с водой, фотографировали образцы и строили фазовые диаграммы по размеру белковых агрегатов. Главным стабилизатором оказался крахмал, сдвигающий образование комков к более вы…
❤8👍3🔥2🤯2👀1
4 Aug 2026, 19:22 UTC68 views9 reactionsread 9 August 2026 Интересное эссе Дафны Коллер (между прочим h-index = 154) о том, почему даже самые мощные методы машинного обучения не компенсируют недостаток причинных данных о механизмах человеческих заболеваний. Создание препаратов делится на стадии идентификации мишени, создания воздействующей молекулы и клиническую проверку
Большинство ИИ-платформ сосредоточено на второй стадии, но клиническая неопределенность часто связана с …
❤5👍2🔥2
3 Aug 2026, 22:48 UTC82 views12 reactionsread 9 August 2026 Photo
Я не знаю, как вообще это пришло авторам в голову, но вот тут они использовали живых трубочников Tubifex tubifex как крупномасштабную модель гибких полимеров. Червей пропускали потоком воды через канал с гексагональной решеткой столбов, похожий на увеличенную хроматографическую колонку (хотя из-за масштаба силы там, конечно, совсем не похожи). Было показано, что время прохождения растет с длиной червя, как у обычных …
❤7👍2🔥2🤨1
3 Aug 2026, 21:27 UTC85 views7 reactionsread 9 August 2026 The Emerald Archive
❤5🔥2
3 Aug 2026, 17:12 UTC84 views10 reactionsread 9 August 2026 Photo
В 2020 году вышла забавная работа "Will Any Crap We Put into Graphene Increase Its Electrocatalytic Effect?" с критикой бесконечного потока статей, в которых графен легируют очередными сочетаниями элементов и почти неизменно объявляют улучшение электрокатализа и "синергетический эффект". Чтобы показать ошибки в логике доказательств во многих работах, в своей статье они обработали графен птичьим пометом и после термоо…
😁8❤1🔥1
2 Aug 2026, 21:01 UTC93 views11 reactionsread 9 August 2026 Photo
GOOSE - инструмент для дизайна внутренне неупорядоченных участков белков (в отличие от обычных белков, у них нет единой стабильной структуры и существуют как ансамбль постоянно меняющихся конформаций). GOOSE проектирует свойства ансамбля (заряд, гидрофобность, компактность, распределение аминокислот и силу взаимодействия с другими цепями) через стохастическую генерацию аминокислотных последовательностей, а размер анс…
❤7👍3🔥1
Showing the 12 most recent of 16 posts we hold for @bio_quorum. View and reaction counts are the latest single reading for each post, not a live figure, and a recent post is still accumulating both. A view count marked ≈ was rounded by Telegram before we ever saw it — t.me prints views in full below 1,000 and to three significant figures above, so ≈1,200,000 means somewhere between 1,150,000 and 1,249,999. Unmarked counts are exact. Text is reproduced from the public post preview and truncated for length.