1 Sept 2026, 06:52 UTC61 views2 reactionsread 2 September 2026 Photo
🐱 اگر یک AI Agent واقعاً قرار باشد وارد پژوهش علمی شود، فقط «مدل زبانی قوی» کافی نیست.
باید بداند برای RNA-seq از چه workflowای استفاده کند، چطور با Scanpy دادههای single-cell را تحلیل کند، چگونه از PubMed، UniProt یا ChEMBL اطلاعات بگیرد، چه زمانی سراغ RDKit یا COBRApy برود و چطور خروجی را به یک گزارش علمی قابلردیابی تبدیل کند.
ریپوی Scientific Agent Skills از K-Dense دقیقاً روی همین مسئله کار میکند.
در نسخه فعل…
❤2
Signed پشتیبانی ویوان
1 Sept 2026, 01:25 UTC28 views3 reactionsread 2 September 2026 Photo
🐀 وقتی رفتار موش آزمایشگاهی به «داده» تبدیل میشود
در بسیاری از مطالعات زیستپزشکی، رفتار حیوان هنوز یکی از دشوارترین فنوتیپها برای اندازهگیری است. یک پژوهشگر ممکن است ساعتها ویدئو ببیند و رفتارهایی مثل راهرفتن، grooming یا تغییرات پوسچر را بهصورت دستی ثبت کند؛ فرایندی که هم زمانبر است و هم میتواند تحت تأثیر قضاوت مشاهدهگر قرار بگیرد.
پژوهشگران The Jackson Laboratory برای حل این مسئله سامانهای به نام JABS …
❤3
Signed پشتیبانی ویوان
29 Aug 2026, 18:24 UTC33 views3 reactionsread 2 September 2026 Photo
📚 وقتی زیستشناسی به مسئلهای برای محاسبه تبدیل میشود 💡
اگر بتوانیم یک مسیر سیگنالینگ را به یک مدل تبدیل کنیم، آیا میتوانیم رفتار آینده آن را هم پیشبینی کنیم؟ 🔮
کتاب Computational Methods in Systems Biology مجموعهای از پژوهشهای حوزه زیستشناسی سامانههاست که نشان میدهد برای مطالعه یک سیستم زیستی همیشه لازم نیست فقط به دادههای آزمایشگاهی نگاه کنیم.
از Boolean Network و مدلهای ODE گرفته تا شناسایی drug targe…
❤3
Signed پشتیبانی ویوان
29 Aug 2026, 18:15 UTC321 views3 reactionsread 2 September 2026 Photo
🤖 وقتی سیستمعامل فقط برای اجرای برنامهها نباشد؛ Omarchy چه سیگنالی برای آینده زیستشناسی دارد؟
سالهاست سیستمعاملها تقریباً با یک منطق ثابت طراحی میشوند:
ما برنامه را باز میکنیم، فایل را پیدا میکنیم، دستور اجرا میکنیم و بین ابزارهای مختلف جابهجا میشویم.
اما ظهور AI Agentها میتواند این رابطه را تغییر دهد. 🧠
در این مدل، واحد اصلی تعامل دیگر لزوماً «برنامه» نیست؛ میتواند هدف باشد.
مثلاً بهجای اینکه خودمان چ…
❤3
Signed پشتیبانی ویوان
26 Aug 2026, 22:39 UTC38 views2 reactionsread 2 September 2026 Photo
📚 اگه بشه یک سلول پستاندار رو مثل یک سیستم مهندسی طراحی کرد، از کجا باید شروع کنیم؟
اولین کتابی که میخوام در بخش library معرفی کنم:
📖 Mammalian Synthetic Systems
زیست شناسی مصنوعی (Synthetic Biology) فقط درباره دستکاری چند ژن نیست. ایده جذابتر اینه که بتونیم رفتار یک سلول رو طراحی، کنترل و حتی برنامهریزی کنیم.
این کتاب دقیقاً وارد همین فضا میشه؛ اما بهجای اینکه فقط درباره مفاهیم حرف بزنه، سراغ روشها و پروتک…
❤2
Signed پشتیبانی ویوان
BioInsight pinned a photo
26 Aug 2026, 20:01 UTC55 views1 reactionsread 2 September 2026 Photo
💡 بیش از ۱۸۰ کانال یوتیوب برای یادگیری Data Science و AI
اگه برای یادگیری Data Science، Machine Learning و AI هی بین کانالهای مختلف یوتیوب میچرخی و آخرش هم نمیدونی کدوم رو دنبال کنی، این Repository میتونه خیلی به کارت بیاد.
توش بیشتر از ۱۸۰ کانال یوتیوب جمع شده و خوشبختانه فقط یه لیست شلوغ از لینکها نیست؛ کانالها موضوعی دستهبندی شدن.
مثلاً برای این حوزهها میتونی کانال پیدا کنی:
✅ Data Science و Data Analys…
❤1
Signed پشتیبانی ویوان
26 Aug 2026, 17:45 UTC36 views1 reactionsread 2 September 2026 Photo
🐷 هشدار بیل گیتس درباره AI و خطر بیوتروریسم
بیل گیتس هشدار داده است که یکی از خطرهای مهم هوش مصنوعی، آسانتر شدن سوءاستفاده از دانش زیستی است.
به گفته او، اطلاعات مربوط به ساخت سلاحهای زیستی از قبل وجود داشته است؛ اما AI میتواند پیدا کردن، فهمیدن و عملیکردن این اطلاعات را برای افراد با تخصص کمتر آسانتر کند.
نگرانی اصلی، ماهیت dual-use این فناوری است: همان ابزارهایی که میتوانند به طراحی دارو، واکسن و تحلیل داده…
😱1
Signed پشتیبانی ویوان
26 Aug 2026, 16:55 UTC31 views1 reactionsread 2 September 2026 Photo
🧬 وقتی GNN و LLM با هم وارد علم مولکولی میشوند، چه چیزی به دست میآید؟
مولکول را میتوان به شکل یک گراف دید؛ اتمها گرههای گراف هستند و پیوندهای شیمیایی ارتباط میان آنها را میسازند. این همان جایی است که Graph Neural Network یا GNN میتواند اطلاعات ساختاری مولکول را یاد بگیرد.
از طرف دیگر، Large Language Model یا LLM میتواند با اطلاعات متنی و نمایشهایی مانند SMILES کار کند و حتی دستورهای زبان طبیعی را پردازش ک…
❤1
Signed پشتیبانی ویوان
24 Aug 2026, 18:15 UTC32 views1 reactionsread 2 September 2026 Photo
🧬 مدل زبانی پروتئین برای تشخیص neuropeptide به چه ویژگیهایی تکیه میکند؟
⚠️ این پژوهش یک preprint است و هنوز peer review نشده است.
مدلهای Protein Language Model مانند ESM-2 میتوانند الگوهای پیچیدهای را از میلیونها sequence یاد بگیرند، اما فهمیدن اینکه یک prediction دقیقاً بر چه ویژگیهایی متکی است، ساده نیست.
در یک کار جدید، پژوهشگران از Sparse Autoencoder برای استخراج featureهای قابلتفسیر از representationهای…
❤1
Signed پشتیبانی ویوان
24 Aug 2026, 12:58 UTC31 views1 reactionsread 2 September 2026 Photo
🧬 ممکن است فیلتر کردن variantهای کمفراوانی mtDNA، بخشی از تاریخچهی سلول را پاک کند
⚠️ این مطالعه یک preprint است و هنوز peer review نشده است.
در lineage tracing، پژوهشگران گاهی از mutationهای mitochondrial DNA برای تشخیص رابطهی سلولها استفاده میکنند. اما variantهایی با heteroplasmy پایین معمولاً به دلیل نگرانی دربارهی noise فیلتر میشوند.
در این مطالعه، پژوهشگران نتیجهی lineage tracing مبتنی بر mtDNA را با le…
❤1
Signed پشتیبانی ویوان
24 Aug 2026, 12:42 UTC30 viewsread 2 September 2026 Photo
🧬 آیا یک مرحله از metabolomics واقعاً میتواند بیش از ۱۰۰ برابر سریعتر شود؟
⚠️ این پژوهش فعلاً یک preprint است و هنوز peer review نشده است.
در تحلیل دادههای LC-MS، مرحلهی feature finding میتواند یکی از بخشهای پرهزینهی محاسباتی باشد. پژوهشگران یک روش جدید با نام Everything Bagel Feature Finder را روی ۸ مجموعهدادهی benchmark آزمایش کردهاند.
طبق گزارش خود نویسندگان، این روش در بعضی شرایط تا ۱۵۰ برابر CPU-hours…
Signed پشتیبانی ویوان
Showing the 12 most recent of 17 posts we hold for @Bioinsight1405. View and reaction counts are the latest single reading for each post, not a live figure, and a recent post is still accumulating both. A view count marked ≈ was rounded by Telegram before we ever saw it — t.me prints views in full below 1,000 and to three significant figures above, so ≈1,200,000 means somewhere between 1,150,000 and 1,249,999. Unmarked counts are exact. Text is reproduced from the public post preview and truncated for length.